Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNRNP35Q16560 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNRNP35Q16560 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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