Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
TNXAQ16473 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TNXAQ16473 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms