Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USF2Q15853 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USF2Q15853 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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