Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SF1Q15637 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SF1Q15637 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SF1Q15637 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
SF1Q15637 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SF1Q15637 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms