Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B3Q15393 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B3Q15393 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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