Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
UBE3CQ15386 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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