Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PDCD1Q15116 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PDCD1Q15116 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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