Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
BRD3Q15059 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
BRD3Q15059 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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