Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SHPRHQ149N8 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SHPRHQ149N8 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms