Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
CHD4Q14839 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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CHD4Q14839 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
CHD4Q14839 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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