Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SMC1AQ14683 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SMC1AQ14683 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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