Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
GBX1Q14549 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
GBX1Q14549 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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