Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CAPRIN1Q14444 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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