Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TCIRG1Q13488 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TCIRG1Q13488 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.8 ms