Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
TOP3AQ13472 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
TOP3AQ13472 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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