Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
LSAMPQ13449 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
LSAMPQ13449 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms