Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
XRCC4Q13426 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
XRCC4Q13426 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
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