Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
MRPL49Q13405 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
MRPL49Q13405 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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