| MPP3 | Q13368 | RNA5SP200-201 | ENST00000516360 | 103 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL160236.1-201 | ENST00000556317 | 195 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | LINC02277-202 | ENST00000556472 | 453 nt | TSL 3 BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR2681-201 | ENST00000581814 | 105 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | Pinc.1-201 | ENST00000616452 | 154 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL391516.1-201 | ENST00000554380 | 2449 nt | BASIC | 2.25 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | OR2L2-202 | ENST00000641771 | 4300 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA25.7-201 | ENST00000364375 | 127 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.273-201 | ENST00000364703 | 102 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-160P-201 | ENST00000384591 | 107 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA48.3-201 | ENST00000391081 | 134 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AC104435.1-201 | ENST00000483483 | 166 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP153-201 | ENST00000516498 | 76 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AC097639.2-201 | ENST00000603159 | 172 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC242852.1-201 | ENST00000612151 | 96 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC244015.1-201 | ENST00000622301 | 99 nt | BASIC | 2.24 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZDBF2-202 | ENST00000611847 | 9890 nt | TSL 5 BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | LRRCC1-202 | ENST00000414626 | 4493 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU1-58P-201 | ENST00000362413 | 163 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MPP3 | Q13368 | RNU2-60P-201 | ENST00000517290 | 128 nt | BASIC | 2.23 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | SKIL-202 | ENST00000413427 | 2702 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | KIF20B-202 | ENST00000371728 | 6419 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.267-201 | ENST00000364679 | 109 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MPP3 | Q13368 | SNORA12.1-201 | ENST00000390873 | 148 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MPP3 | Q13368 | AL353689.1-201 | ENST00000438895 | 199 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
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| MPP3 | Q13368 | YWHAEP4-201 | ENST00000505390 | 198 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC007751.1-201 | ENST00000529260 | 376 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | JPX_2.1-201 | ENST00000614161 | 69 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | uc_338.20-201 | ENST00000621563 | 178 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR6852-201 | ENST00000621699 | 66 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR6079-201 | ENST00000635807 | 62 nt | BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | PRKD3-201 | ENST00000234179 | 5900 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | FSIP2-206 | ENST00000611759 | 3882 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC108866.1-201 | ENST00000503073 | 2339 nt | TSL 5 BASIC | 2.22 | □□□□□ -2.05 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.66-201 | ENST00000362862 | 102 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.253-201 | ENST00000364562 | 112 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP37-201 | ENST00000365420 | 130 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR597-201 | ENST00000384968 | 97 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR17-201 | ENST00000385012 | 84 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORD72-201 | ENST00000390994 | 80 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU11-3P-201 | ENST00000391111 | 133 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | MLLT10P1-201 | ENST00000418346 | 262 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL158823.1-201 | ENST00000418441 | 478 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | HMGN2P3-201 | ENST00000433603 | 273 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | HMGN2P5-201 | ENST00000436882 | 273 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | MRPS17P9-201 | ENST00000511924 | 393 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL353149.1-201 | ENST00000610667 | 244 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL359075.3-201 | ENST00000613288 | 217 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | ST7-OT4_1.1-201 | ENST00000615322 | 200 nt | BASIC | 2.21 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | CSNK1G3-202 | ENST00000360683 | 4047 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | PTPRQ-209 | ENST00000616559 | 8165 nt | TSL 5 BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | CXADR-202 | ENST00000356275 | 270 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-23P-201 | ENST00000363283 | 107 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP493-201 | ENST00000364115 | 91 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU6-1325P-201 | ENST00000364905 | 105 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNRPGP10-201 | ENST00000432323 | 225 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNU1-131P-201 | ENST00000458943 | 161 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | HMGN1P7-201 | ENST00000491722 | 313 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | SCARNA16.3-201 | ENST00000516595 | 184 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC131055.1-201 | ENST00000584626 | 316 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | NPPA-AS1_2.1-201 | ENST00000618496 | 149 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC245060.5-201 | ENST00000610778 | 3293 nt | BASIC | 2.2 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC018630.2-201 | ENST00000534866 | 2403 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | TAB2-205 | ENST00000538427 | 4240 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | Y_RNA.280-201 | ENST00000364765 | 112 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | RNA5SP338-201 | ENST00000410495 | 85 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL035461.1-201 | ENST00000421490 | 332 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AL356320.1-201 | ENST00000429616 | 163 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | ATP5J2P3-201 | ENST00000451550 | 258 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | TRBV12-1-201 | ENST00000479785 | 344 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | MIR3169-201 | ENST00000578032 | 83 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZNF415-224 | ENST00000601493 | 2132 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | AC104819.3-201 | ENST00000603264 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | CLRN1-AS1.1-201 | ENST00000615643 | 79 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | ZNF732-201 | ENST00000419098 | 2193 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | KTN1-204 | ENST00000395311 | 4516 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | SLC39A10-201 | ENST00000359634 | 5322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| MPP3 | Q13368 | SNORA1B-201 | ENST00000362535 | 133 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |