Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GPS1Q13098 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
GPS1Q13098 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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