Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MRPL28Q13084 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MRPL28Q13084 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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