| FLII | Q13045 | RNU6-1168P-201 | ENST00000390831 | 104 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | AL353614.1-201 | ENST00000445631 | 206 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | AC110009.1-201 | ENST00000512965 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1333P-201 | ENST00000516162 | 93 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | RNU7-25P-201 | ENST00000516544 | 62 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.690-201 | ENST00000516603 | 95 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP481-201 | ENST00000516814 | 122 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | IGHVIII-67-2-201 | ENST00000519849 | 88 nt | BASIC | 3.31 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FLII | Q13045 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP68-201 | ENST00000363885 | 119 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FLII | Q13045 | RNU7-12P-201 | ENST00000516030 | 62 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | MIR6817-201 | ENST00000615588 | 66 nt | BASIC | 3.3 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | ATP2B1-201 | ENST00000261173 | 6777 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.127-201 | ENST00000363386 | 109 nt | BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
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| FLII | Q13045 | MIR133A1HG-202 | ENST00000581072 | 4226 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.29 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.261-201 | ENST00000364631 | 102 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | MIR891A-201 | ENST00000401237 | 79 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | snoU13.27-201 | ENST00000459278 | 104 nt | BASIC | 3.28 | □□□□□ -1.88 | | |
| FLII | Q13045 | MIRLET7C-201 | ENST00000362160 | 84 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-28-201 | ENST00000363931 | 81 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-424P-201 | ENST00000384367 | 105 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
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| FLII | Q13045 | Y_RNA.547-201 | ENST00000384654 | 119 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD77.3-201 | ENST00000391113 | 65 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AL136985.1-201 | ENST00000424592 | 395 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SUMO1P4-201 | ENST00000429430 | 302 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC131956.1-201 | ENST00000506420 | 258 nt | TSL 2 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC010210.1-203 | ENST00000513905 | 260 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP385-201 | ENST00000515947 | 110 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP148-201 | ENST00000516527 | 94 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | HMSD-204 | ENST00000526932 | 162 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AL359881.1-201 | ENST00000602916 | 267 nt | BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | PLD1-217 | ENST00000627725 | 174 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | CACNB4-238 | ENST00000636901 | 7706 nt | TSL 5 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | ZMYM1-203 | ENST00000373330 | 4203 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | LCOR-205 | ENST00000421806 | 16004 nt | TSL 3 BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AASDH-207 | ENST00000513376 | 3241 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.27 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | MTND5P32-201 | ENST00000560711 | 1802 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AL603914.1-201 | ENST00000401964 | 204 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AL445646.1-201 | ENST00000431784 | 216 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SNRPGP14-201 | ENST00000435400 | 219 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP320-201 | ENST00000516263 | 124 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | MIR4506-201 | ENST00000584693 | 77 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC078899.2-201 | ENST00000595282 | 212 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC245884.12-201 | ENST00000615364 | 59 nt | BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | ZNF470-202 | ENST00000391709 | 6601 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.26 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | ZNF732-201 | ENST00000419098 | 2193 nt | APPRIS P2 TSL 2 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-235P-201 | ENST00000362644 | 107 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | U8.9-201 | ENST00000365667 | 134 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP210-201 | ENST00000391034 | 120 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP76-201 | ENST00000516277 | 87 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SCARNA16.3-201 | ENST00000516595 | 184 nt | BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | SACS-201 | ENST00000382292 | 15324 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.25 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | OGN-201 | ENST00000262551 | 2971 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1189P-201 | ENST00000383958 | 107 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.410-201 | ENST00000383992 | 113 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | MIR27B-201 | ENST00000385129 | 97 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AL353747.2-201 | ENST00000439207 | 205 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1149P-201 | ENST00000516810 | 97 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC124657.1-201 | ENST00000527819 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC104819.3-201 | ENST00000603264 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | GS1-279B7.1-204 | ENST00000641809 | 378 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | FAR1-204 | ENST00000532502 | 5820 nt | TSL 2 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-833P-201 | ENST00000363486 | 107 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-309P-201 | ENST00000364573 | 106 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP100-201 | ENST00000410903 | 110 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP59-201 | ENST00000410922 | 110 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | ARHGAP28-204 | ENST00000419673 | 5492 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RPL23AP94-201 | ENST00000512518 | 302 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | 5S_rRNA.3-201 | ENST00000517021 | 110 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | RNU2-60P-201 | ENST00000517290 | 128 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | AC090049.2-201 | ENST00000550377 | 109 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | 5S_rRNA.19-201 | ENST00000612131 | 110 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | 5S_rRNA.18-201 | ENST00000621941 | 110 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| FLII | Q13045 | CCPG1-203 | ENST00000442196 | 3453 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |