Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTP4A2Q12974 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTP4A2Q12974 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms