Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
FOXO1Q12778 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
FOXO1Q12778 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms