Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ERFP50548 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
ERFP50548 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ERFP50548 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ERFP50548 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ERFP50548 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ERFP50548 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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