Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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PTPRBP23467 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PTPRBP23467 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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