Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RBM28Q9NW13 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
RBM28Q9NW13 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.1 ms