Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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LHX9Q9NQ69 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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LHX9Q9NQ69 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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LHX9Q9NQ69 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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LHX9Q9NQ69 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LHX9Q9NQ69 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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LHX9Q9NQ69 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.82□□□□□ -2.28
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LHX9Q9NQ69 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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LHX9Q9NQ69 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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