Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
OTOP3Q7RTS5 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.55□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
OTOP3Q7RTS5 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237.7 ms