Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CCDC142Q17RM4 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CCDC142Q17RM4 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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