Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RTN1Q16799 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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RTN1Q16799 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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RTN1Q16799 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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RTN1Q16799 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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RTN1Q16799 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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RTN1Q16799 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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RTN1Q16799 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
RTN1Q16799 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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