Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
CDKN3Q16667 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
CDKN3Q16667 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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