Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIL3Q16649 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIL3Q16649 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms