Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SNAPC1Q16533 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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SNAPC1Q16533 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
SNAPC1Q16533 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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