Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKN1Q16512 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKN1Q16512 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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