Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CCDC6Q16204 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CCDC6Q16204 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
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