Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.58□□□□□ -2
VPS72Q15906 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.57□□□□□ -2
VPS72Q15906 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPS72Q15906 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VPS72Q15906 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VPS72Q15906 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.53□□□□□ -2
VPS72Q15906 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
VPS72Q15906 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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