Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
KRT31Q15323 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1□□□□□ -2.25
KRT31Q15323 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms