Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
NCAPHQ15003 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NCAPHQ15003 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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