Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CSHL1Q14406 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
CSHL1Q14406 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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