Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
GTF2H2Q13888 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
GTF2H2Q13888 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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