Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.29□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.3□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.31□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.31□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.33□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.33□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
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SHROOM2Q13796 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
SHROOM2Q13796 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
SHROOM2Q13796 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
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