Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
ALCAMQ13740 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ALCAMQ13740 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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