Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
CDH18Q13634 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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