Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXE3Q13461 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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