Protein–RNA interactions for Protein: Q13454

TUSC3, Tumor suppressor candidate 3, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUSC3Q13454 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
TUSC3Q13454 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
TUSC3Q13454 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUSC3Q13454 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUSC3Q13454 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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