Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
TMED1Q13445 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
TMED1Q13445 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms