Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SF3B2Q13435 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SF3B2Q13435 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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