Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
XRCC4Q13426 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
XRCC4Q13426 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms