Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
RIGQ13278 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
RIGQ13278 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
RIGQ13278 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
RIGQ13278 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms